Bergara está situada en el centro de la Comunidad Autónoma Vasca, al suroeste de Gipuzkoa, en la comarca del Alto Deba (Debagoiena). Su ubicación es estratégica, dado que confluyen en ella la autopista Eibar-Vitoria y la autovía Beasain-Durango. Así, tanto Bilbao como San Sebastián y Vitoria quedan cercanas.
Las principales vías de conexión para llegar a Bergara son la autopista AP-1 y la carretera GI-627.
En caso de venir por la carretera N-1, se deberá llegar a través de la carretera GI-632.